日本的櫻花大多為染井吉野櫻和山櫻。但日本全國各地，有超過一百種的櫻花樹種類。
不同的櫻花樹種類特色也不同。下列舉出幾個比較明顯的差異，即使是入門者也能輕易辨認：
花瓣數量：
大部分的野生樹種，還有許多栽培樹種都只有5個花瓣。但有些樹種花瓣卻超過5個，甚至10個、20個或更多。超過5個花瓣的樹種稱為八重櫻。
5片花瓣
(圖示為大島櫻)
約20片花瓣
(圖示為一葉櫻)
約100片花瓣
(圖示為菊櫻)
花朵色彩：
多數櫻花種類的花朵為淡粉紅色或白色，但也有些櫻花是深粉紅或淡黃色的。有些櫻花的顏色在盛開後仍會改變，例如從白色變成粉紅色。
白色花朵
(圖示為松月)
粉紅色花朵
(圖示為關山櫻)
黃色花朵
(圖示為鬱金)
新芽：
開花較早的樹通常在花朵盛開之後，才會出現新芽，讓櫻花樹看起來就像櫻花盛開時一樣吸引人。較晚開花的樹新芽通常在花開前就會出現，讓櫻花樹看起來有多種風貌。另外，新芽的顏色也會因樹種不同而有差異。多數新芽都是綠色、銅棕色、或介於兩者之間的顏色。
綻放時間：
多數櫻花都是在春天開。但也有少數幾種，是在秋末和冬天才開。舉例而言，八重櫻，有5片花瓣以上的櫻花種類，通常都是最晚開花的，比起大多數5瓣櫻花樹種要晚開2到4個星期。
樹的姿態：
櫻花樹生長習性不同，也形成不同的姿態：三角形、圓柱形、V形、垂枝形、平頂形等等。垂枝形的櫻花樹又稱為枝垂櫻。
下列為一些日本櫻花樹種。這個櫻花盛開時間表是依東京的狀況而列出的。
  | 染井吉野櫻 (吉野櫻) 染井吉野櫻是於江戶時期培育出來的品種，是日本為數最多的櫻花樹種。染井吉野櫻的花瓣是接近白色的淡粉紅，有5個花瓣。 |
  | 山櫻 山櫻是日本原生的野生種，多半生長在山區。花瓣為淡粉紅色，且有5片小花瓣。 |
  | 枝垂櫻（垂枝形櫻花） 枝垂櫻是垂枝形的櫻花樹，樹枝是往下垂吊的。有的櫻花是5瓣，有的則超過5瓣。後者稱為八重枝垂櫻。 |
  | 一葉 一葉的每朵花約有20片淺粉紅色花瓣。新芽呈現綠色。 |
  | 鬱金 鬱金每朵花約有10-20片花瓣，且其葉子為銅色。鬱金因為花朵呈現黃色，因此很容易辨識。 |
  | 關山櫻 在眾多八重櫻種類當中，關山櫻是數量最多的一種。一朵關山櫻花含30-50片粉紅花瓣。新芽呈現銅棕色。 |
  | 普賢象櫻 普賢象櫻是較晚盛開的八重櫻，每朵花約有30-40片花瓣。初綻放時為白色至淺粉紅色，盛開較久後，花瓣顏色會轉為深粉紅色。新芽呈現銅棕色。 |
  | 松月 松月是較晚盛開的八重櫻，花朵較大，為白色，約有20-30片花瓣。新芽呈現綠色。 |
  | 菊櫻 (Chrysanthemum Cherry) 菊櫻每一朵花都有高達100片花瓣！它也是最晚盛開的樹種。事實上，等到花朵盛開時，新芽也早就長成，躲在花叢之中了。 |
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