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本頁介紹日本縣市及短程巴士，以及搭乘方法。有關長程巴士旅遊，則可參考高速巴士篇。

京都市公車

在東京、大阪及一些其他大城市，巴士是次級大眾運輸交通工作，填補火車及捷運網絡的不足。在許多火車網絡比較不密集的城市，例如京都，巴士是主要的大眾運輸交通工具。

巴士服務路線還包括規模較小的城鎮、鄉下及國家公園。主要城市之間則進一步由高速及長程巴士來串連。

如何搭乘巴士
對外籍遊客而言，在日本搭乘巴士可能相當教人卻步，因為通常英語標示和廣播非常欠缺，而各巴士公司的搭乘系統又不一樣。以下是最常見系統的說明，隨後並有明顯例外附註：

從後門上車(如果整座公車只有一個門，就從前門)。
上車時，從小型機器上拿取車票。票上有一個數字，之後是靠這個數字決定您的票價。
司機上方的顯示板會顯示下一站站名，以及以日圓計價的票價。將車票上的數字與顯示板上的數字和票價互相比對，就能得知所需支付的票價。
當巴士靠近您要下車的那一站時，請按一下牆上按鈕，示意司機您想在下一站下車。
若您需要找錢，請使用換鈔機換零錢。
下車時，請將車票及數目剛好的票錢放進司機旁邊的盒子裡。
許多城市或市區中心，例如京都中央，會實施單一票價。也就是說，不管您的目的地遠近，票價都一樣。這意味著您可以不必顧慮上述說明的步驟2和3。

當然上述系統也有一些例外情形。最顯著例外就是東京都會巴士。乘客必須從前門上車，付統一票價，最後由後門下車。